Es sind die gefährlichsten und häufigsten Trojaner. Mit einem Backdoor-Trojaner kann der Urheber oder „Master“ des Trojaners mit Hilfe von Fernadministration den Opferrechner angreifen. Im Gegensatz zu den legitimen Fernadministrationsprogrammen sind die Backdoor-Trojaner für den Computernutzer unsichtbar. Sie installieren, starten und lassen Programme laufen ohne seine Zustimmung oder sein Wissen. Wenn sie einmal installiert sind, können Backdoor-Trojaner Dateien verschicken, empfangen, ausführen oder löschen, sie können vertrauliche Daten aus dem Computer entnehmen, Computeraktivitäten protokollieren und mehr.